🌶️在Python中使用生物表达语言(BEL)的生态系统。
演示PyBEL和PyBEL工具使用的笔记本
从生物表达语言(BEL)编码的生物知识图中生成动态结构因果模型
用于DrugBank的Bio2BEL包(https://www.drugbank.ca)。
在BEL中整合KEGG路径相关信息的Bio2BEL包
使用生物表达语言(BEL)统一路径数据库
系统和网络生物学中知识图谱的生成和应用
在BEL中整合来自Reactome的路径相关信息
一个用于可视化和编辑路径模型的网络应用程序
INDRA(综合网络和动态推理组装器)是一个自动模型组装系统,与NLP系统和数据库对接,收集知识,并通过组装过程,产生因果图和动态模型。
COBRApy是一个用于基于约束的代谢网络建模的软件包。