生物学表达语言开源项目点评

pybel

Python

🌶️在Python中使用生物表达语言(BEL)的生态系统。

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doctoral-thesis

TeX

系统和网络生物学中知识图谱的生成和应用

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bio2bel

Python

用生物表达语言(BEL)整合生物数据库和结构化数据源的Python框架

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PathMe

Python

使用生物表达语言(BEL)统一路径数据库

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kegg

Python

在BEL中整合KEGG路径相关信息的Bio2BEL包

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bel-enrichment

Python

使用INDRA和PyBEL生成用于合理地丰富BEL图的策展表的软件包

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drugbank

Python

用于DrugBank的Bio2BEL包(https://www.drugbank.ca)。

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bel2scm

Jupyter Notebook

从生物表达语言(BEL)编码的生物知识图中生成动态结构因果模型

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pybel-notebooks

Jupyter Notebook

演示PyBEL和PyBEL工具使用的笔记本

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reactome

Python

在BEL中整合来自Reactome的路径相关信息

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