生物信息学是一个跨学科的领域,与生物学、计算机科学、数学和统计学相交叉。它关注的是用于收集和分析生物数据的方法和软件工具的开发和使用。
带有视频讲座的计算机科学课程列表。
用于Python、R、Julia和Jupyter的分析性网络应用。不需要JavaScript。
Biopython的官方git仓库(最初由CVS转换)。
DeepVariant是一个分析管道,使用深度神经网络从下一代DNA测序数据中调用遗传变体。
社区策划的单细胞软件包和数据资源列表,包括RNA-seq、ATAC-seq等。
一个精心策划的生物信息学库和软件的列表。
用于数据驱动的计算管道的DSL
生物康达频道的康达食谱。
一个超快的一体化FASTQ预处理器(QC/适配器/修剪/过滤/分割/合并...)。
GATK 4及以上版本的官方代码库
科学的工作流程引擎,旨在实现简单性和可扩展性。在一次性使用案例和大规模生产环境之间轻松过渡
在pandas DataFrames中处理分子结构
用于化学和生物学中的图形神经网络的Python软件包
:眼。绘制DNA序列特征的Python库(例如来自Genbank文件)。
一个用于工程生物的Go软件包。
COBRApy是一个用于基于约束的代谢网络建模的软件包。
用于管理和分析生物医学大数据的开源平台
一个通往(开放生物医学)本体的Python前端。
:pencil2。一个多功能的DNA序列优化器
INDRA(综合网络和动态推理组装器)是一个自动模型组装系统,与NLP系统和数据库对接,收集知识,并通过组装过程,产生因果图和动态模型。